Auch wenn die Wasserqualität der Alz sich in den letzten Jahrzehnten verbessert hat, führten menschliche Eingriffe dazu, dass das Ökosystem Alz immer noch leidet. Der Fluss wurde teilweise begradigt, Auen trockengelegt. Staustufen und Dämme behindern Fische bei ihren Wanderungen. Die Mitgliedsunternehmen des Vereins Naturnahe Alz wollen mithelfen, diese Fehler der Vergangenheit zumindest teilweise zu beheben. Durch eine Renaturierung soll dem Fluss wieder mehr Raum gegeben werden, um das Ökosystem Alz zu stärken.